在合同纠纷案件中，鉴定意见作为重要的证据之一，对于法院判断事实真相、作出公正判决具有关键作用。然而，由于鉴定意见的专业性较强，其真实性和可靠性往往成为争议焦点。因此，在审查鉴定意见时，应当注重以下几个要点：
一、鉴定机构和人员的资质
首先，应审查鉴定机构是否具备合法资质，鉴定人员是否拥有相应的专业背景和执业资格。合法资质的鉴定机构和专业人员能够确保鉴定意见的科学性和权威性。根据我国《司法鉴定程序通则》的规定，从事司法鉴定业务的人员应当具有与所申请从事的司法鉴定业务相关的高级专业技术职称；或者具有相关行业执业资格或者高等院校相关专业本科以上学历，从事相关工作五年以上。
二、鉴定程序的合法性
其次，要审查鉴定程序是否符合法律规定。这包括但不限于：鉴定委托程序是否合法、鉴定材料是否充分且经过双方质证、鉴定过程是否公开透明等。只有程序合法，才能保证鉴定结果的真实性和客观性。
三、鉴定方法和依据的科学性
再者，需关注鉴定采用的方法和依据是否科学合理。不同的鉴定领域有不同的标准和方法，应结合具体案情审查鉴定过程中使用的理论基础、技术手段以及数据分析是否符合行业公认的标准或规范。
四、鉴定意见的合理性与一致性
最后，要考察鉴定意见是否与案件事实相符，是否存在逻辑矛盾或与其他证据相冲突的情况。同时，还应注意鉴定意见是否全面考虑了所有相关因素，避免片面化解读。
综上所述，在处理合同纠纷案件时，对鉴定意见进行严格审查至关重要。通过上述几个方面的综合考量，可以更准确地评估鉴定意见的价值，从而为法院提供更加可靠的事实依据，促进案件公正审理。此外，当事人及其代理人也应充分利用这一环节，积极提出质疑，促使法庭全面审查证据，以保障自身合法权益。