检察院退回补充侦查两次后，案子通常有以下几种走向： 作出不起诉决定 存疑不起诉：如果经过两次补充侦查，检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件，应当作出不起诉决定。例如在一些盗窃案件中，若缺乏关键的监控录像、指纹等直接证据，且补充侦查后仍无法获取，检察院会作出存疑不起诉决定。此时，诉讼程序暂时终止，被羁押的当事人会被释放，但案件并非永久性终结，若发现新证据，符合起诉条件时，仍可再次起诉。 法定不起诉：如果在补充侦查过程中，发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者存在《刑事诉讼法》第十六条规定的情形，如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的等，检察院应当作出法定不起诉决定，这种情况下案件彻底终结，不会再起诉。 相对不起诉：若犯罪嫌疑人犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚，检察院可以作出相对不起诉决定。比如在一些轻微的诈骗案件中，犯罪嫌疑人诈骗金额较小，且有自首、退赃等情节，检察院可能会作出相对不起诉决定。 提起公诉：如果补充侦查后，案件证据达到确实、充分的标准，符合起诉条件，检察院会向法院提起公诉，案件进入审判程序。法院将对案件进行审理，根据查明的事实、证据和有关法律规定，作出有罪或无罪判决。若作出有罪判决，还会根据犯罪情节等确定刑罚。 特殊情况：在某些极其特殊的情况下，如补充侦查过程中发现新的犯罪事实或新的犯罪嫌疑人等重大问题，可能会导致案件的侦查方向或范围发生重大改变，需要重新展开全面侦查，但这种情况相对较少。 此外，如果公安机关对不起诉决定有异议，可要求复议；若意见不被接受，还可向上一级检察院提请复核。被害人若不服不起诉决定，可自收到决定书后七日以内向上一级检察院申诉，也可以不经申诉，直接向法院提起自诉。